3 октября 2022 г.
В недавнем исследовании, опубликованном в Open Forum Infectious Diseases, исследователи продемонстрировали клинические особенности и инфекционность доминирующего в настоящее время варианта (VOC) коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2) Omicron по сравнению с Delta, ранее доминирующим VOC.
Исследование: клинические признаки и продолжительность вирусного Выделение у людей с омикронным вариантом инфекции SARS-CoV-2. Изображение предоставлено: Вячеслав Лопатин/Shutterstock
Фон
Корейское агентство по контролю и профилактике заболеваний подтвердило 11 случаев заражения вирусом Омикрон и незамедлительно перевело этих пациентов в Медицинский центр Инчхон (IMC), оборудованный изолированными палатами с отрицательным давлением. У всех этих пациентов была легкая или умеренная форма коронавирусной болезни 2019 (COVID-19) и один или несколько симптомов на момент постановки диагноза.
Хотя ни один из пациентов не имел ослабленного иммунитета и не получал дополнительный кислород, стероиды или другие противовоспалительные препараты, два пациента получали терапию моноклональными антителами. У пяти пациентов также была пневмония с признаками поражения паренхимы легкого. Примечательно, что двое пациентов даже получили вторую дозу вакцины против COVID-19 в октябре 2021 года. Пять из этих пациентов были мужчинами, а шесть — женщинами, средний возраст всех — 38 лет.
О исследование
В рамках настоящего исследования исследователи собрали 110 серийных образцов из дыхательных путей 11 пациентов, у которых была подтверждена инфекция SARS-CoV-2, вызванная Omicron, в декабре 2021 года во время первой вспышки Omicron в Южной Корее. Они культивировали эти образцы в клеточной линии Vero E6 в течение 14 дней после появления симптомов, чтобы оценить уровень положительности вирусной культуры.
Они оценили инфекционное выделение вируса Омикроном, уровень положительных результатов посева и клинические симптомы. Они определили нагрузки рибонуклеиновой кислоты (РНК) SARS-CoV-2 в образцах из дыхательных путей, то есть log10 копий РНК на мл в зависимости от продолжительности симптомов в днях. Кроме того, исследователи использовали анализ полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-PCR) в реальном времени, чтобы определить пороговые значения цикла (CT) для гена оболочки (E) SARS-CoV-2. Исследователи преобразовали среднее значение CT в течение 14 дней после появления симптомов в вирусную нагрузку, чтобы сравнить количественные различия на основе вирусной нагрузки.
Результаты исследования
Исследователи выделили Омикрон из 48 образцов невакцинированных пациентов. в течение восьми дней после появления симптомов. Среди тех, кто получил лечение моноклональными антителами, у одного была положительная культура, а у другого — отрицательная. Они отметили максимальное значение CT гена E, равное 28,96, для 48 образцов, которые дали культивируемые вирусы.
Уровень положительных результатов вирусной культуры Omicron колебался от 22% до 100% у невакцинированных пациентов в течение восьми дней после появления симптомов. По сравнению с Delta, у Omicron была более короткая продолжительность положительного результата вирусной культуры (восемь против 10 дней), но более высокая величина (100% против 74%). Впоследствии у пациентов, инфицированных Омикроном, вирусная нагрузка колебалась от 1,86 × от 104 копий/мл до 5,69 × 108 копий/мл. Омикрон имел более короткую инфекционную стадию, чем Дельта; тем не менее, уровень положительности культуры у Омикрона был выше, чем у варианта Дельта. Возможно, именно поэтому Омикрон так быстро распространился по всему миру.
Омикрон содержит множество уникальных мутаций в рецептор-связывающем домене белка шипа (S) (RBD) и сайте расщепления фурином (FCS). Первые мутации усиливали его трансмиссивность, а вторые повышали его инфекционность и патогенность. Еще один ключевой вывод исследования заключался в том, что продолжительность лихорадки может плохо коррелировать со временем конверсии вирусной культуры. Недостаточно доказательств того, что снижение лихорадки обеспечивает научную основу для выхода из изоляции. Дальнейшие исследования должны определить, имеет ли улучшение лихорадки значительную связь со снижением инфекционности.
Выводы
Текущее исследование показало, как SARS-CoV-2 культивируется из респираторных образцов людей, инфицированных Omicron. может служить суррогатной мерой инфекционности Омикрона. Эти вирусные культуры стали отрицательными через девять дней после появления симптомов, что свидетельствует о том, что Омикрон был заразен в течение более короткого периода времени. Тем не менее, его культурально-положительный уровень был выше, чем у дельта-варианта, что объясняет, почему его случаи резко возросли во всем мире. В целом данные исследования подтверждают высокую трансмиссивность варианта Omicron.
Ссылка на журнал:
- Jang, Y. et al. (2022) «Клинические особенности и продолжительность выделения вируса у лиц с омикронным вариантом инфекции SARS-CoV-2», Open Forum Infectious Diseases, 9(7). doi: 10.1093/ofid/ofac237. https://academic.oup.com/ofid/article/9/7/ofac237/6582525?login=false
